Packagech.unil.cbg.ExpressionView.model
Classpublic class GeneExpressionData
InheritanceGeneExpressionData Inheritance flash.events.EventDispatcher



Public Properties
 PropertyDefined By
  dataOrigin : Boolean
GeneExpressionData
  geneLabels : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  GenesLookup : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  GenesLookupP : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  goLabels : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  keggLabels : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  moduleLabels : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  Modules : XMLListCollection
GeneExpressionData
  ModulesColors : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupGenes : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupGOs : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupGOsP : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupKEGGs : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupKEGGsP : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupModules : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  ModulesLookupSamples : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  nGenes : int
GeneExpressionData
  nModules : int
GeneExpressionData
  nSamples : int
GeneExpressionData
  sampleLabels : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  SamplesLookup : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  SamplesLookupP : Vector.<Array>
GeneExpressionData
  xAxisLabel : String
GeneExpressionData
  XMLData : XML
GeneExpressionData
  yAxisLabel : String
GeneExpressionData
Public Methods
 MethodDefined By
  
GeneExpressionData
  
GeneExpressionData
  
getInfo(module:int, gene:int, sample:int):Array
GeneExpressionData
  
GeneExpressionData
  
initialize(data:XML):void
GeneExpressionData
Property Detail
dataOriginproperty
public var dataOrigin:Boolean

geneLabelsproperty 
public var geneLabels:Vector.<Array>

GenesLookupproperty 
public var GenesLookup:Vector.<Array>

GenesLookupPproperty 
public var GenesLookupP:Vector.<Array>

goLabelsproperty 
public var goLabels:Vector.<Array>

keggLabelsproperty 
public var keggLabels:Vector.<Array>

moduleLabelsproperty 
public var moduleLabels:Vector.<Array>

Modulesproperty 
public var Modules:XMLListCollection

ModulesColorsproperty 
public var ModulesColors:Vector.<Array>

ModulesLookupGenesproperty 
public var ModulesLookupGenes:Vector.<Array>

ModulesLookupGOsproperty 
public var ModulesLookupGOs:Vector.<Array>

ModulesLookupGOsPproperty 
public var ModulesLookupGOsP:Vector.<Array>

ModulesLookupKEGGsproperty 
public var ModulesLookupKEGGs:Vector.<Array>

ModulesLookupKEGGsPproperty 
public var ModulesLookupKEGGsP:Vector.<Array>

ModulesLookupModulesproperty 
public var ModulesLookupModules:Vector.<Array>

ModulesLookupSamplesproperty 
public var ModulesLookupSamples:Vector.<Array>

nGenesproperty 
public var nGenes:int

nModulesproperty 
public var nModules:int

nSamplesproperty 
public var nSamples:int

sampleLabelsproperty 
public var sampleLabels:Vector.<Array>

SamplesLookupproperty 
public var SamplesLookup:Vector.<Array>

SamplesLookupPproperty 
public var SamplesLookupP:Vector.<Array>

xAxisLabelproperty 
public var xAxisLabel:String

XMLDataproperty 
public var XMLData:XML

yAxisLabelproperty 
public var yAxisLabel:String

Constructor Detail
GeneExpressionData()Constructor
public function GeneExpressionData()



Method Detail
generatedModules()method
public function generatedModules():Array

Returns
Array
getInfo()method 
public function getInfo(module:int, gene:int, sample:int):Array

Parameters

module:int
 
gene:int
 
sample:int

Returns
Array
getModule()method 
public function getModule(module:int):GeneExpressionModule

Parameters

module:int

Returns
GeneExpressionModule
initialize()method 
public function initialize(data:XML):void

Parameters

data:XML